Wie von der inFamous-Reihe gewohnt, wird man auch in inFamous Second Son die Möglichkeit haben, an einigen Stellen selbst Entscheidungen zu treffen, die den weiteren Spielverlauf verändern können. In den vergangenen Ablegern der Serie war man bei den jeweiligen Entscheidungen aber leider immer etwas eingeengt, da man im Grunde nur zwischen zwei extremen wählen konnte. Im Fall von inFamous Second Son gaben die Entwickler an, dass man diesmal mehr Möglichkeiten haben soll. Wie nun bekannt wurde, gibt es in inFamous Second Son aber nur zwei verschiedene Enden die jeweils den bösen und den guten Handlungsstrang vollenden.
Die Informationen zu den verschiedenen Enden stammen von der Tapei Game Show auf der ein Sucker Punch Sprecher folgendes Kommentar abgegeben hat.
„Laut den Entwicklern gibt es zwei verschiedene Enden. Eines für den bösen Weg und eines für den guten Weg. Die Entscheidungen die man im Spielverlauf trifft, werden Einfluss auf den weiteren Spielverlauf nehmen, insgesamt gibt es aber nur zwei verschiedene Enden.“